Родился в 1928 году, был восьмым ребенком в крестьянской семье Ивана и Евдокии Халиных. Окончил семь классов неполной средней школы в 1945 году, затем школу ФЗУ (школа фабрично-заводского ученичества). Некоторое время работал ремонтником шоссейных дорог; в 1948 году был призван на военную службу в Советскую Армию. Уволен в запас 26 октября 1951 года.
1 августа 1957 года поступил послушником в Глинскую пустынь, где его духовником стал глинский старец схиархимандрит Андроник (Лукаш). В период жизни в Глинской обители послушник Сергий Халин тяжело заболел крупозным воспалением легких. Старец Андроник затворился в келье со своим смертельно больным духовным сыном и спустя три дня тот вернулся к жизни.
После закрытия Глинской пустыни в период «хрущёвских гонений» Сергий перешел в Псково-Печерский монастырь.
15 ноября 1957 года Сергей Халин пишет прошение на имя настоятеля монастыря архимандрита Августина (Судоплатова) о принятии в число братии обители. В монастыре стал келейщиком валаамского старца иеросхимонаха Михаила (Питкевича). Они принимали исповедь друг у друга. 12 февраля 1959 года епископом Псковским и Порховским Иоанном (Разумовым) пострижен в мантию с именем Ипполит в честь святого Ипполита Римского.
20 февраля 1959 года рукоположен во иеродиакона, 14 июня 1960 года рукоположен в иеромонаха.
В 1966 году, в числе группы монахов Псково-Печерского монастыря, которым впервые властями Греции было дозволено прибыть на Афон из СССР, был направлен в Пантелеимонов монастырь, где провел последующие 17 лет; подвизался в келье прп. Силуана Афонского (Старый Русик). Нёс послушания казначея, эконома, представлял Пантелеимонов монастырь в Священном Киноте. 4 сентября 1983 года был вынужден покинуть Афон по состоянию здоровья. Распоряжением Председателя Отдела внешних церковных сношений Московской патриархии митрополита Филарета (Вахромеева) вернулся в Псково-Печерский монастырь.
14 октября 1984 года возведен в сан игумена, 14 апреля 1985 года – в сан архимандрита.
16 октября 1991 года Ипполит был назначен настоятелем находившегося в руинах Рыльского Николаевского монастыря Курской епархии, возрождению которого посвятил последние 11 лет своей жизни.
В Рыльский монастырь с первых дней после открытия потянулись люди, чтобы помолиться на молебнах о недужных, которые старец служил практически ежедневно. Начиная с середины 1990-х годов на эти молебны, особенно по субботам собирались сотни паломников из разных регионов страны. В субботние дни в монастырь приезжало до 12 автобусов с богомольцами. По окончании молебна архимандрит Ипполит вел прием на левом клиросе нижнего храма во имя иконы Божией Матери Знамение Курская Коренная. Иногда прием проходил в коридорчике у входа в келью старца. По свидетельству братии и паломников, не обладавший даром слова старец, никогда не говоривший проповедей, имел от Господа дар утешения. Ему достаточно было сказать человеку, находившемуся в тяжелых жизненных обстоятельствах, буквально несколько слов: «Терпения Вам!», «Спаси Вас Господи! Дай Бог Вам здоровья!», и тот, кто несколько минут назад подходил к старцу в слезах, покидал его с улыбкой. Вместо назиданий, архимандрит часто читал посетителям стихи о любви.
В сложные годы после распада СССР к старцу приходили люди, оставшиеся без работы и средств к существованию, освободившиеся из мест заключения, страдающие от алкоголизма, наркомании, некрещеные, исповедующие иные религии. Многие из них находили временное пристанище в Рыльском монастыре или в монастырских домиках в Пригородной слободке. В монастырской трапезной ежедневно кормили десятки, а в иные дни сотни богомольцев. Щедрой рукой рыльский старец творил тайную милостыню. После его кончины братия разбирала мешки писем, хранившиеся в его келье, среди них были письма заключённых с благодарностью за оказанную помощь.
Народное почитание
В 2005 году в поселке Марьино Курской области на территории санатория Управления делами администрации Президента России Марьино – усадьбы князей Барятинских был открыт памятник архимандриту Ипполиту работы народного художника России В. М. Клыкова, почитавшего старца и называвшего его «великим человеком».
18 июля 2018 года на территории Богоявленского Аланского женского монастыря (Алагирский район республики Северная Осетия) торжественно открыт памятник основателю обители с отдельной мемориальной табличкой: «Архимандриту Ипполиту – апостолу Алании 21 века». Автор памятника народный художник Республики Северная Осетия – Алания Владимир Соскиев. Освящал монумент архиепископ Владикавказский и Аланский Леонид (Горбачёв).
18 апреля 2018 года в конференц-зале гостиницы «Даниловская» при большом стечении народа состоялся вечер, посвящённый 90-летию со дня рождения архимандрита Ипполита. Организаторы вечера – Рыльский Николаевский монастырь, Ассоциация учителей православной культуры города Москвы, Общество «Алтарь Отечества», Союз православных женщин, Всероссийское Общество ревнителей памяти архимандрита Ипполита. В вечере принимали участие представители синодальных структур Московского Патриархата, настоятели монастырей и храмов, ученые, деятели культуры, педагоги, студенты духовных семинарий и профессиональных колледжей.
15 мая 2021 года Рыльский Свято-Николаевский мужской монастырь по благословению митрополита Курского и Рыльского Германа (Моралина) объявил о начале сбора свидетельств прижизненной и посмертной благодатной помощи по молитвам архимандрита Ипполита (Халина).
17 декабря 2022 года в 20-ю годовщину кончины старца на федеральном телеканале «Спас» состоялась премьера документального фильма «Батюшка Ипполит».
21 декабря 2022 года в конференц-зале гостиницы «Даниловская» состоялся вечер памяти архимандрита Ипполита с участием представителей общественности, игуменов и игумений монастырей, с презентацией книги «Батюшка Ипполит», содержащей новые свидетельства помощи по молитвам рыльского старца.
